El Parque Nacional Natural los Nevados es un área del Sistema de parques Nacionales, en la cual se conservan los ecosistemas de páramo en su gran extensión, los bosques alto andinos, humedales de alta montaña y tres de los 6 picos glaciares con que aún cuenta nuestro país, en estos ecosistemas habitan numerosas especies de aves, mamíferos, anfibios e insectos que son los taxones más estudiados y con mayores reportes en el área protegida.
El área cuenta con un total de 30 especies de aves, de las cuales 8 son endémicas, es decir cuya distribución se halla exclusivamente en Colombia y 22 más de distribución compartida con alguno de los países hermanos, en cuanto a los mamíferos, el área protegida y su zona de influencia cuenta hasta el momento con 8 endemismos de mamíferos.
Pequeños mamíferos endémicos confirmados (Sciurus) Microsciurus pucheranii, Microsciurus santanderensis, Aepeomys fuscatus, Akodon affinis, Cryptotis colombiana. Otros 3 pequeños mamíferos del grupo de los roedores presentan alta probabilidad de poder considerarse como endémicos los cuales son Oryzomys munchiquensis, Akodon tolimae y Thrinacodus albicauda, Para los anfibios Cinco especies pertenecen a la familia Bufonidae y cuatro a la familia Leptodactylidae (Atelopus carauta, Eleutherodactylus ruizi, Eleutherodactylus scopaeas, Eleutherodactylus simoteriscus y Eleutherodactylus xestus), los cuales se encuentran reportadas dentro del PNN Los Nevados y su Zona de Amortiguación.
Entre las especies más llamativas que se pueden observar en el PNN Los Nevados se encuentra la Danta de Páramo (Tapirus pinchaque), el Venado colorado (Mazama rufina), el conejo de paramo (Sylvilagus brasiliensis) la Boruga (Cuniculus taczanowiski), el venado conejo (Pudu mephistophiles), el Puma o León de montaña (Puma concolor), el Tigrillo (Leopardus tigrinus).
Se pueden también observar otras especies como el periquito de los nevados Bolborhynchus ferrugineifrons, el cóndor de los andes Vultur gryphus, el pato andino Oxyura jamaicensis, el perico paramuno Leptosittaca branickii, el tucán terlaque andino Andigena hypoglauca, la danta de páramo Tapirus pinchaque, el venado conejo Pudu mephistophiles y el venado colorado Mazama rufina, entre otras especies de gran interés que son endémicas ya que sólo se encuentran en estos ecosistemas o están amenazadas de extinción.
Entre las especies de flora que se encuentran en el parque están las palmas del género Ceroxylon y se pueden observar varias de sus representantes amenazadas como la palma de cera del Quindío Ceroxylon quindiuense Árbol Nacional de Colombia. Otras especies importantes y de fácil observación son los siete cueros Polylepis serícea y los frailejones del género Espeletia.