El Palacio Arzobispal de Manizales ocupa un lote de 1.795 metros cuadrados y cuenta con un área construida de 3.691 metros cuadrados distribuidos en dos niveles, con alturas diversas. Su estructura combina muros de mampostería y concreto con algunos sectores en bahareque encementado, técnica que hizo parte de la tradición constructiva de la región. Los entrepisos y cielorrasos fueron elaborados en madera, mientras que la cubierta integra terrazas, placas de concreto, fibrocemento y marquesinas, reflejando las soluciones arquitectónicas propias de la época de reconstrucción.

Tiene una planta rectangular que se organiza alrededor de un amplio patio jardín central, rodeado por corredores perimetrales con arcos que se asocian a la distribución de los antiguos claustros. A este espacio se suma un segundo patio ubicado hacia el costado suroriental, también rodeado por galerías que aportan iluminación, ventilación y una adecuada articulación entre las distintas dependencias del edificio.

La fachada principal constituye uno de sus mayores valores estéticos del edificio. El acceso está enmarcado por un frontón triangular sostenido por columnas corintias adosadas al muro y enriquecido con molduras de inspiración clásica. Otro valor importante de la arquitectura es la ornamentación, atribuida a los arquitectos José María Gómez y Benjamín Dussán Canals, incorpora frisos, cornisas, ménsulas y relieves que aportan sobriedad y equilibrio características propias de la arquitectura republicana presente en el Centro Histórico de Manizales.